Ebook: Физикохимия и биология торфа. Методы оценки численности и разнообразия бактериальных и актиномицетных комплексов торфяных почв

Томск: Издательство: ТГПУ, 2010. — 108с. — ISBN: 9785894284965.Впервые подготовлено учебное пособие для микробиологов, работающих с торфяными почвами. В содержание этого пособия включены как теоретические вопросы (дана оценка состояния современной систематики бактерий и экологической оценки микробного разнообразия), так и все методические рекомендации, касающиеся определения численности и идентификации бактерий и актиномицетов.
Авторы предлагают новые экологические подходы к оценке бактериального разнообразия почв. Приводится перечень экологических индексов биоразнообразия, которые рекомендуются для количественной оценки структуры прокариотных сообществ почв. Даны списки родов бактерий и актиномицетов, наиболее характерных для торфяных почв и сопряженных субстратов, и ключи для их идентификации. Описаны методы и тесты, необходимые для определения прокариотных микроорганизмов. Приводится состав сред, рекомендуемых для выделения из почв бактерий и актиномицетов разных групп и родов.Содержание.
Бактериальные комплексы торфяников.
Состояние современной систематики и классификации бактерий.
Методы, используемые для классификации и идентификации прокариот.
Традиционный метод посева - "новые возможности старого метода".
- теоретические основы экологической оценки микробного разнообразия.
- экологические индексы, рекомендуемые для оценки структуры бактериальных сообществ почвы.
Спектр основных родов бактерий, обнаруженных в торфяных почвах.
Количественный учет бактерий в торфе с помощью люминесцентной микроскопии.
Ключ для определения основных родов почвенных бактерий. Принципы составления и пояснения к ключу.
Методы и тесты, необходимые для проведения родовой идентификации.
- изучение культуральных и морфологических свойств бактерий.
- проведения физиолого-биохимических тестов: тест на оксидазу, окислительно-ферментативный тест на использованиеглюкозы (тест Хью-Лейфсона), тест на каталазу, тест на нуклеазы, тест на уреазу, тест на дезаминирование фенилаланина, тест на аргининдезиминазу, тест на декарбоксилаз аминокислот, тест на использование фумарта в анаэробных условиях, реакция Вогес-Проскауэра, тест на липазу, тест на протеиназы, гидролиз желатины, тест на гидролиз казеина, тест на диастазу, тест на наличие целлюлозы, тест на наличие пектиназной активности, тест на наличие хитиназы, тест на использование углеводов и органических кислот.
- методы хемотакономического анализа. Определение типа клеточной стенки: выявление изомеров диаминопимелиновой кислоты, выявление сахаров, определение аминокислотного состава пептидогликана клеточной стенки, выявление ацетильных и гликокильных групп пептидогликана клеточной стенки, обнаружение миколовых кислот, обнаружение менахинонов, определение техоевых кислот.
Среды и методы для выделения и учета блока аэробных и факультативно-анаэробных гетеротрофных бактерий в почвах и сопряженных субстратах.
- методы селективного ингибирования.
- спеицальные среды.
- среды для выделения гармотрицательных бактерий.
- среды для выделения миксобактерий.
- среды для выделения грамположительных бактерий.
Актиномицетные комплексы торфяников.
Разнообразие актиномицетов в торфяниках.
Ключ для определения родов почвенных актиномицетов, наиболее распространенных в почвах и сопряженных с ней субстратах.
Методологические аспекты оценки актиномицетного разнообразия в наземных экосистемах.
- выделение актиномицетов из почв и растительных субстратов.
- дифференцированный учет и идентификация актиномицетов.